本发明提供一种不需要气井关井并且计算结果偏差较小的基于流压测试的多层合采气井分层地层压力计算方法,包括以下步骤,第一步:收集多层合采气井的井底流压测试数据、小层物性和小层产量数据;第二步:根据流压和流压梯度测试值计算小层出气口对应的井底流压;第三步:根据气井小层的原始含水饱和度和目前产气量、产水量,计算小层目前的含水饱和度;第四步:根据不同泥质含量岩心的相渗实验数据,回归确定不同泥质含量岩心的相渗曲线方程;第五步:根据小层泥质含量匹配相渗曲线方程,计算小层气相相对渗透率;第六步:根据气井产能方程计算小层的地层压力。本发明将测试与气井渗流理论结合,计算的小层地层压力准确度较高。