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专利号: 2020106241346
申请人: 北部湾大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
更新日期:2026-06-16
缴费截止日期: 暂无
联系人

摘要:

权利要求书:

1.基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组,其特征在于,所述分子标记引物组为下述引物中的任意1对:AmhAT3上游引物:5’-TAGCCGAGTGGTGGTCTTCT-3’;下游引物:5’-TGATGAGGTGCATCTAACTTGG-3’;

AmhAT7上游引物:5’-AAACCAGTTGGAACAATCACG-3’;下游引物:5’-TCTTCTGCCACATCATCATCA-3’;

AmhAT8上游引物:5’-TCTCTGGAGTGCATGGTGTT-3’;下游引物:5’-TGGTCACTTCCCATGACTTG-3’;

AmhAT12上游引物:5’-TGCAAAGTGCATTTGTGTACG-3’;下游引物:5’-AGATGGCGCTTGTCAAGACT-3’;

AmhAT14上游引物:5’-GCCACGCTGTTTGTATGTTC-3’;下游引物:5’-AAAGCCACATCTTGCTCCTC-3’;

AmhAT33上游引物:5’-TTGGTTCGAAAATACATGAACG-3’;下游引物:5’-AAACTCGGGCTCATTTTCCT-3’;

AmhAT59上游引物:5’-GTTGGCACCATCCAACTTTT-3’;下游引物:5’-CCCAAACTACGACCTGCACT-3’;

AmhAT60上游引物:5’-TGATTTTGCATGATCGAGACA-3’;下游引物:5’-CCCCAGCACAAATCACTTTT-3’。

2.根据权利要求1所述基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组,其特征在于,所述引物组能对不同地域的白骨壤进行聚类分析。

3.根据权利要求2所述基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组,其特征在于,所述不同地域的白骨壤为:防城港采集的白骨壤和北海采集的白骨壤。

4.一种如权利要求1所述基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组的构建方法,其特征在于,所述方法包括提取普通白骨壤的基因组DNA、对DNA进行测序、对测序完成的DNA序列进行质量检测、提取含有hAT转座元件的序列、根据hAT转座子两端的保守区域合成相应引物、用引物对不同品种的白骨壤进行扩增,选取具有特异性的引物构建引物组。

5.根据权利要求4所述基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组的构建方法,其特征在于,所述对测序完成的DNA序列进行质量检测的方法为检测N50,N90,GC含量,N含量等信息评估测序质量,选取测序质量高的转录组;去除接头,低质量序列和不确定的碱基;

对修剪过的转录组进行组装、延伸。

6.根据权利要求4所述基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组的构建方法,其特征在于,所述引物对不同品种的白骨壤进行扩增时的PCR反应体系为:ddH2O 3.6μl,2×Taq的PCR Master Mix 5μl,上游引物0.2μl,下游引物0.2μl,DNA模板1μl;PCR扩增程序为:预变性95℃4min;变性95℃45s,退火60℃45s,延伸72℃45s,33个循环;复性72℃7min;4℃下保存。

7.如权利要求1所述基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组的应用,其特征在于,该引物用于检测不同白骨壤品种的亲缘关系及遗传多样性。