1.一种基于理性设计改造的高热稳定性内切型褐藻酸裂解酶突变体，其特征在于：所述突变体为褐藻酸裂解酶AlyRm6A氨基酸序列的第43位的苏氨酸突变为异亮氨酸，即突变体T43I；

或，突变体为褐藻酸裂解酶AlyRm6A氨基酸序列的第216位的谷氨酰胺突变为异亮氨酸，即突变体Q216I；

所述褐藻酸裂解酶AlyRm6A的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。

2.编码权利要求1所述的高热稳定性内切型褐藻酸裂解酶突变体的基因。

3.一种表达载体，其特征在于：所述表达载体含有权利要求2所述的基因。

4.一种基因工程菌，其特征在于：所述基因工程菌含有权利要求3所述的表达载体。

5.一种权利要求1所述的突变体的应用，其特征在于：权利要求1所述突变体在催化褐藻胶发生β消去反应制备褐藻寡糖中的应用。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于：权利要求1所述突变体以褐藻胶PolyMG、褐藻胶PolyM、褐藻胶PolyG中的一种或几种为底物在催化制备褐藻寡糖中的应用。