本发明涉及医学、生物学领域的实验设备,尤其涉及一种自动振荡混匀装置,包括底座、摇板和摇箱,所述摇板设置在底座上,所述摇箱设置在摇板上端面且与摇板可拆卸连接;所述底座包括电机、主动轮、从动轮和传动轴,传动轴上连接有振荡结构;振荡结构包括偏心轴与偏心轮;摇板下端面设置有圆槽和第一环形槽,圆槽的槽壁上设有通孔,通孔内设有凸起和推板,圆槽周围设置有第二环形槽,第一环形槽内设置有气囊,所述偏心轴上转动连接有连杆,连杆自由端上设有圆柱形凸块,圆柱形凸块滑动连接在第二环形槽内,底座下端面设有支撑块,支撑块内设有竖直通孔,竖直通孔与气囊的进气口之间连接有导气管。本发明能够对痰液标本批量自动振荡混匀。