本发明属于微生物技术领域,公开了一种约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii EU03)及其应用。本发明所述约氏乳杆菌可提高肠道菌群中乳杆菌(Lactobacillus),Muribaculaceae(p<0.05),阿克曼菌(Akkermansia),Allobaculum,拟杆菌(Bacteroides)(p<0.05)和Blautia等肠道优势菌群的丰度,降低Romboutsia,Lachnospiraceae_NK4A136等菌群的丰度,对肠道菌群结构具有正向调节作用,从而改善代谢综合征等症状;并对肠道菌群相关代谢产物的调节作用,降低氧化三甲胺(TMAO)相关代谢物胆碱浓度、同时提高甜菜碱浓度,提高肠道菌群中提高短链脂肪酸(SCFAs)的浓度,起到缓解心血管疾病的作用。