1.一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:所述方法包括以下步骤:S1 构建重新划分的基于基因组序列数据组的BED文件并转换成约定格式文件;
S2构建基因组序列数据组间的参考,获得T2T基因组的参考;
S3 基于基因组序列数据组和原始真实数据,分别与S2的参考信息作用,以cellranger软件及对应的处理流程处理,获得基因组序列数据表征及对应的细胞类型标签;
S4 处理S3的基因组序列数据表征后输入构建的全连接网络模型,训练至预设条件;
S5 提取待分类的基因组序列数据表征,处理后输入训练后的全连接网络模型,得到分类结果。
2.根据权利要求1所述的一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:S1中,所述基于基因组序列数据组的BED文件包括基因组序列数据组的起始位置、结束位置及对应的基因序号。
3.根据权利要求1所述的一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:S2中,基于标准数据格式和CellRanger软件完成参考数据的处理。
4.根据权利要求1所述的一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:S3中,处理后生成基因组序列数据组的10X矩阵数据,获取对应的数据表达矩阵Z,Z的行对应基因组序列数据组的块序号,列对应每个细胞。
5.根据权利要求4所述的一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:处理S3后生成的细胞类型标签,标记类别,得到每个细胞序号和类别的对应关系S,从数据表达矩阵Z中划定训练集和测试集。
6.根据权利要求4所述的一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:S4中,处理S3的基因组序列数据表征包括对数据表达矩阵Z中的数据进行缩放,得到m行n列的标准化新矩阵 ,,
其中,min(Z)为矩阵Z中的最小值,max(Z)为矩阵中的最大值,min_val和max_val为预设的放缩范围的下限和上限。
7.根据权利要求6所述的一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:处理新矩阵 ,获得全连接网络模型的输入 ,,
其中, 为矩阵 中第i行第j列元素值,i为0至m‑1的整数,j为0至n‑1的整数,t为列的序号。
8.根据权利要求1所述的一种基于单细胞基因组表达的细胞分类方法,其特征在于:S4中,全连接网络模型包括顺次连接的输入层、若干组线性处理模块和输出层;所述线性处理模块为三组,任一组所述线性处理模块包括顺次连接的激活函数层、dropout层和全连接层;线性处理模块的线性层的节点数逐次减小。
9.一种计算机可读存储介质,其特征在于:其上存储有基于单细胞基因组表达的细胞分类程序,该程序被处理器执行时实现权利要求1 8之一所述的基于单细胞基因组表达的~细胞分类方法。
10.一种计算机设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于:所述处理器执行所述程序时,实现权利要求1 8之一所述的基于单~细胞基因组表达的细胞分类方法。