1.一种靶向敲除ATG5基因的gRNA引物,其特征在于,由靶向第一靶点T1的第一gRNA引物和靶向第二靶点T2的第二gRNA引物组成 ;其中第一靶点T1序列为AGTGGATAATCTTTATGGCATGG,如SEQ ID NO:1所示;第二靶点T2序列为TCATGACAACATGCTGACAGTGG,如SEQ ID NO:2所示。
2.如权利要求1所述的靶向敲除ATG5基因的gRNA引物,其特征在于,所述第一gRNA引物的序列为:ATG5‑gF1:CACCG AGTGGATAATCTTTATGGCA,如SEQ ID NO:3所示;ATG5‑gR1:AAACTGCCATAAAGATTATCCACTC,如SEQ ID NO:4所示;
第二gRNA引物的序列为ATG5‑gF2:CACCGTCATGACAACATGCTGACAG,如SEQ ID NO:5所示;
ATG5‑gR2:AAACCTGTCAGCATGTTGTCATGAC,如SEQ ID NO:6所示。
3.一种ATG5基因敲除用表达系统,其特征在于,由表达载体和报告载体组成;其中表达载体由以第一gRNA引物为拟合引物构建的的第一载体和以第二gRNA引物为拟合引物构建的的第二载体组成;第一载体和第二载体均为CRISPR/Cas9;报告载体为以含有第二靶点的Tar引物为拟合引物构建的SSA‑RPG;其中第一gRNA引物靶向第一靶点T1,第一靶点T1序列为AGTGGATAATCTTTATGGCATGG,如SEQ ID NO:1所示;第二gRNA引物靶向第二靶点T2,第二靶点T2序列为TCATGACAACATGCTGACAGTGG,如SEQ ID NO:2所示。
4.如权利要求3所述的ATG5基因敲除用表达系统,其特征在于,第一gRNA引物的序列为:ATG5‑gF1:CACCG AGTGGATAATCTTTATGGCA,如SEQ ID NO:3所示;ATG5‑gR1:AAACTGCCATAAAGATTATCCACTC,如SEQ ID NO:4所示;
第二gRNA引物的序列为ATG5‑gF2:CACCGTCATGACAACATGCTGACAG,如SEQ ID NO:5所示;
ATG5‑gR2:AAACCTGTCAGCATGTTGTCATGAC,如SEQ ID NO:6所示。
Tar引物的序列为:ATG5‑TF:GGCCGCCTCGAGCCTCTAATGCTACCACTCAGAGGTCATGACAACATGCTGACAGTGGTGATGAG,如SEQ ID NO:7所示;
ATG5‑TR:GATCCTCATCACCACTGTCAGCATGTTGTCATGACCTCTGAGTGGTAGCATTAGAGGCTCGAGGC,如SEQ ID NO:8。
5.一种ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株,其特征在于,由如权利要求3、4所述的表达系统中的第一载体、第二载体和报告载体同时转染HUVEC构建而成。
6.一种如权利要求5所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,包括以下操作步骤:
1)构建表达载体和报告载体:
A:构建第一表达载体:
a:合成靶向ATG5的第一靶点T1的第一gRNA引物;
b:将第一gRNA引物拟合,得拟合产物;
c:用BsaⅠ酶切质粒pX330‑U6‑Chimeric_BB‑CBh‑hSpCas9即CRISPR/Cas9表达载体,将酶切回收的骨架和拟合产物连接,然后将连接产物转化感受态细菌DH5α,涂含氨苄青霉素的LB固体培养基的平板上,培养后挑取单克隆,接种在含氨苄青霉素LB液体培养基中,培养后离心收集菌体,提取质粒,获得靶向ATG5基因的第一载体,记为ATG5‑1.CRISPR/Cas9;
B:合成靶向ATG5的第二靶点T2的第二gRNA引物,按照构建第一表达载体同样的构建方法构建第二表达载体,记为ATG5‑2.CRISPR/Cas9C:合成含有第二靶点T2的Tar引物,以SSA‑RPG为骨架,按照构建第二表达载体同样的构建方法构建报告载体,记为ATG5.SSA‑RPG;
2)转染与筛选:
将步骤1)构建的ATG5‑1.CRISPR/Cas9、ATG5‑2.CRISPR/Cas9和ATG5.SSA‑RPG同时转染到HUVEC细胞中,嘌呤霉素筛选后,挑取单克隆,即构建获得ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株。
7.如权利要求6所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,步骤b中拟合体系是上下游引物各5ul,拟合程序是100℃10分钟,然后放置常温后再放至4℃。
8.如权利要求6所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,步骤c中酶切反应体系为:pX330‑U6‑Chimeric_BB‑CBh‑hSpCas9 4μL,BsaⅠ 0.8μL,CutSmart
4μL,H2O 31.2μL,37℃酶切4小时。
9.如权利要求6所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,步骤c中连接反应体系为:pX330‑U6‑Chimeric_BB‑CBh‑hSpCas9酶切骨架回收产物2.5μL,gRNA 2μL,T4连接酶0.5μL,10×buffer 1μL,H2O 4μL,16℃连接10h;其中拟合产物与酶切后骨架的摩尔比为3:1,拟合产物与酶切骨架的质量和为50~150ng。
10.如权利要求6所述的ATG5基因敲除的人血管内皮细胞株的构建方法,其特征在于,步骤2)中ATG5‑1.CRISPR/Cas9、ATG5‑2.CRISPR/Cas9和ATG5.SSA‑RPG的用量比例为1:1:2。