1.与油茶种子油脂中软脂酸含量相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记为PB.34365.1‑621;
SNP分子标记PB.34365.1‑621如SEQ ID NO.3所示,其中,第621位的多态性为C/T。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记PB.34365.1‑621中,具有所述多态性的位点的基因型为T/T,对应于低软脂酸含量,基因型为C/C或C/T,对应于候选高软脂酸含量。
3.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物。
4.根据权利要求3所述的引物,其特征在于,包括如SEQ ID NO.1‑2所示的引物。
5.含有权利要求3或4所述的引物的试剂或试剂盒。
6.权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3或4所述的引物或权利要求5所述的试剂或试剂盒的以下任一应用:(1)在鉴定油茶种子油脂中软脂酸含量表型中的应用;
(2)在油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用,所述油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种的性状为油茶种子油脂中软脂酸含量;
(3)在油茶种子油脂中软脂酸含量的早期预测中的应用;
(4)在筛选低软脂酸含量油茶中的应用。
7.鉴定油茶种子油脂中软脂酸含量表型的方法,其特征在于,包括:(1)提取待鉴定油茶的总RNA,反转录合成cDNA;
(2)以cDNA为模板,利用权利要求3或4所述的引物进行PCR扩增;
(3)分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型,根据所述基因型判断待鉴定油茶种子油脂中的软脂酸含量表型。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述PCR扩增的反应程序为:94
95℃,3 5min;94 95℃,15 30s,65 69℃,40 60s,38 45个循环;67 70℃,3 6min。
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9.根据权利要求7或8所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定油茶种子油脂中的软脂酸含量表型的方法为:若SNP分子标记PB.34365.1‑621具有所述多态性的位点的基因型为T/T,则待鉴定油茶为低软脂酸含量;若基因型为C/C或C/T,则待鉴定油茶为候选高软脂酸含量。
10.鉴定低软脂酸含量油茶的方法,其特征在于,包括:(1)提取待鉴定油茶的总RNA,反转录合成cDNA;
(2)以cDNA为模板,利用权利要求3或4所述的引物进行PCR扩增;
(3)分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型,根据所述基因型判断待鉴定油茶是否为低软脂酸含量油茶;若SNP分子标记PB.34365.1‑621具有所述多态性的位点的基因型为T/T,则待鉴定油茶为低软脂酸含量油茶。