1.与油茶种子油中硬脂酸含量相关的SNP分子标记,其特征在于,包括PB.35271.1-548或PB.35271.1-555;
其中,SNP分子标记PB.35271.1-548含有如SEQ ID NO.1所示序列第548位的多态性为C/T的核苷酸序列;SNP分子标记PB.35271.1-555含有如SEQ ID NO.1所示序列的第555位的多态性为G/A的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记PB.35271.1-548中,具有所述多态性的位点的基因型为CC,对应于高硬脂酸含量,基因型为TT,对应于低硬脂酸含量,基因型为CT,对应于候选低硬脂酸含量;所述SNP分子标记PB.35271.1-555中,具有所述多态性的位点的基因型为GG,对应于高硬脂酸含量,基因型为AA,对应于低硬脂酸含量,基因型为AG,对应于候选低硬脂酸含量。
3.与油茶种子油中硬脂酸含量相关的SNP分子标记组合,其特征在于,所述SNP分子标记组合包括PB.35271.1-548和PB.35271.1-555;
其中,SNP分子标记PB.35271.1-548和PB.35271.1-555同权利要求1或2中所述。
4.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的引物。
5.根据权利要求4所述的引物,其特征在于,包括如SEQ ID NO.2-3所示的引物。
6.含有权利要求4或5所述的引物的试剂或试剂盒。
7.权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合或权利要求
4或5所述的引物或权利要求6所述的试剂或试剂盒的以下任一应用:(1)在鉴定油茶种子油中硬脂酸含量表型中的应用;
(2)在油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用,所述油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种的性状为种子油中的硬脂酸含量;
(3)在油茶种子油中硬脂酸含量早期预测中的应用;
(4)在筛选高硬脂酸含量油茶中的应用。
8.鉴定油茶中硬脂酸含量表型的方法,其特征在于,包括:
(1)提取待鉴定油茶的总RNA,反转录合成cDNA;
(2)以cDNA为模板,利用SEQ ID NO.2-3所示引物进行PCR扩增;
(3)分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的基因型,根据所述基因型判断待鉴定油茶的硬脂酸含量表型。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序为:94~95℃,3~
5min;94~95℃,15~30s,65~69℃,40~60s,38~45个循环;67~70℃,3~6min。
10.根据权利要求8或9所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定油茶的硬脂酸含量表型的方法如下:若SNP分子标记PB.35271.1-548具有所述多态性的位点的基因型为CC,则待鉴定油茶为高硬脂酸含量,若基因型为TT,则待鉴定油茶为低硬脂酸含量,基因型为CT,则待鉴定油茶为候选低硬脂酸含量;和/或,若SNP分子标记PB.35271.1-555具有所述多态性的位点的基因型为GG,则待鉴定油茶为高硬脂酸含量,若基因型为AA,则待鉴定油茶为低硬脂酸含量,基因型为AG,则待鉴定油茶为候选低硬脂酸含量。