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专利号: 2020104567702
申请人: 中国林业科学研究院亚热带林业研究所
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
更新日期:2026-09-16
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.与油茶种子油脂中油酸和亚油酸含量相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记为PB.8541.2‑812;

SNP分子标记PB.8541.2‑812的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,其中第812位的多态性为T/C。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记PB.8541.2‑812中,具有所述多态性的位点的基因型为CC,对应高油酸低亚油酸含量,基因型为TT,对应低油酸高亚油酸含量。

3.与油茶种子油脂中油酸和亚油酸含量相关的SNP分子标记组合,其特征在于,所述SNP分子标记组合为PB.34365.1‑621、PB.8541.2‑812和PB.35271.1‑555中的至少两个;

其中,SNP分子标记PB.34365.1‑621的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其中第621位的多态性为C/T;SNP分子标记PB.8541.2‑812的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,其中第812位的多态性为T/C;SNP分子标记PB.35271.1‑555的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,其中第

555位的多态性为G/A。

4.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的引物。

5.根据权利要求4所述的引物,其特征在于,包括SEQ ID NO.6‑7所示引物,或者选自SEQ ID NO.4‑5、SEQ ID NO.6‑7和SEQ ID NO.8‑9所示引物中的至少两对。

6.含有权利要求4或5所述的引物的试剂或试剂盒。

7.权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合或权利要求

4或5所述的引物或权利要求6所述的试剂或试剂盒的以下任一应用:(1)在鉴定油茶种子油脂中油酸和/或亚油酸含量表型中的应用;

(2)在油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用,所述种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种的性状为种子油脂中的油酸和/或亚油酸含量;

(3)在油茶种子油脂中油酸和/或亚油酸含量早期预测中的应用;

(4)在筛选高油酸低亚油酸含量油茶中的应用;

(5)在筛选低油酸高亚油酸含量油茶中的应用。

8.鉴定油茶种子油脂中油酸和亚油酸含量表型的方法,其特征在于,包括:(1)提取待鉴定油茶的总RNA,反转录合成cDNA;

(2)以cDNA为模板,利用SEQ ID NO.4‑5、SEQ ID NO.6‑7、SEQ ID NO.8‑9所示引物中的一对或多对进行PCR扩增;

(3)分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的基因型,根据所述基因型判断待鉴定油茶种子油脂中的油酸和亚油酸含量表型。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序为:94 95℃,3~ ~

5min;94 95℃,15 30s,65 69℃,40 60s, 38 45个循环;67 70℃,3 6 min。

~ ~ ~ ~ ~ ~ ~

10.根据权利要求8或9所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定油茶种子油脂中的油酸和亚油酸含量表型的方法如下:若SNP分子标记PB.34365.1‑621具有所述多态性的位点的基因型为TT,则待鉴定油茶为高油酸低亚油酸含量,基因型为CC,则待鉴定油茶为低油酸高亚油酸含量,基因型为CT,则待鉴定油茶为候选高油酸低亚油酸含量;和/或,若SNP分子标记PB.8541.2‑812中,具有所述多态性的位点的基因型为CC,则待鉴定油茶为高油酸低亚油酸含量,基因型为TT,则待鉴定油茶为低油酸高亚油酸含量;和/或,若SNP分子标记PB.35271.1‑555中,具有所述多态性的位点的基因型为GG,则待鉴定油茶为高油酸低亚油酸含量,基因型为AA,则待鉴定油茶为低油酸高亚油酸含量。