1.一种获得已知序列侧翼未知序列的方法，其特征在于：包括如下步骤：(1)选择已知序列，设计两条方向一致的特异性引物，从远离边界序列到靠近边界序列的顺序依次标记为SP1和SP2，SP2带限制性内切酶识别位点，在SP2到边界序列之间再设计一对反向PCR引物F1和D1；

(2)以基因组DNA为模板，以6种兼并引物AD分别和所述SP1进行第一轮PCR扩增，得到有扩增条带的PCR产物1；

(3)以所述的有扩增条带的PCR产物1为模板，使用特异的SP2引物和步骤(2)中同种但加入限制性内切酶识别位点的相对应的兼并引物AD’扩增得到PCR产物2；

(4) 将PCR产物2酶切后加入T4连接酶环化，以此为模板，使用F1和D1为引物，扩增得到PCR产物3，从所述PCR产物3中获得侧翼序列。

2.根据权利要求1所述的一种获得已知序列侧翼未知序列的方法，其特征在于：所述兼并引物AD及加入限制性内切酶识别位点的兼并引物AD’为如下：AD1：NTCGASTWTSGWGTT、AD’1：NTCGASTWTSGWGTTCCCGGG ；

AD2：NGTCGASWGANAWGAA、 AD’2 ：NGTCGASWGANAWGAACCCGGG；

AD3：NGTASASWGTNAWCAA、 AD’3：NGTASASWGTNAWCAACCCGGG；

AD4：STTGNTASTNCTNTGC、AD’4：STTGNTASTNCTNTGCCCCGGG ；

AD5：AGWGNAGWANCAWAGG、 AD’5：AGWGNAGWANCAWAGGCCCGGG；

AD6 ：TGWGNAGWANCASAGA、 AD’6：TGWGNAGWANCASAGACCCGGG。