本发明属于微生物发酵技术领域,具体涉及一种复合微生物菌在生产2,3‑丁二醇中的应用。本发明所利用的复合微生物菌由过表达2,3‑丁二醇脱氢酶的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis MW‑BS1)和地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis MW‑BL2)两种微生物菌组成,其中,枯草芽孢杆菌与地衣芽孢杆菌的接种体积之比为2:1。本发明以合成2,3‑丁二醇为主的枯草芽孢杆菌为复合微生物菌的主发酵菌,以合成乙偶姻为主的地衣芽孢杆菌为复合微生物菌的辅助发酵菌,利用二者代谢的互补作用,补充2,3‑丁二醇合成途径所需的中间代谢物,优化发酵体系中酶系反应,提高了2,3‑丁二醇产量的同时有效降低了副产物的积累,最终,2,3‑丁二醇的产量高达98.7 g/L,乙偶姻的产量几乎为0,本发明为高效生物发酵生产2,3‑丁二醇提供了新方案。