本发明属于污水处理技术领域,具体涉及一种复合型微生物絮凝剂及其制备方法和应用,所述的絮凝剂重量组成为:微生物混和干粉30~60份,微生物载体5~20份,无机助凝剂10~30份,表面改性剂5~10份。本发明絮凝剂为固体粉末状,不易腐败变质,便于运输和储存,选用蜡状芽泡杆、枯草芽泡杆菌、光合细菌、酵母菌的进行发酵培养和干粉提取,解决了直接投加上述微生物存在的有效利用率低,絮凝作用弱、储存和使用不便利的问题。本发明以微生物混合干粉为主要原料,并与载体、助凝剂和表面活性剂复配而成复合型微生物絮凝剂,可发挥各复配组份的优点,从而达到取长补短的目的,对污水处理效果优良,特别适用于工业废水深度处理中应用。