1.一种水稻的InDel4分子标记,其特征在于,所述InDel4分子标记位于如SEQ ID No.1所示的水稻基因CTS4编码区;InDel4分子标记包括三个点位,分别为位于序列SEQ ID No.1第283‑331位的第一点位;位于序列SEQ ID No.1第389‑391位的第二点位;位于序列SEQ ID No.1第482‑484位的第三点位。
2.一种用于扩增权利要求1所述的InDel4分子标记的引物对,其特征在于,包括如SEQ ID No.2所示的正向引物:5'‑CCTGAGTCACAAGCACGAAA‑3';如SEQ ID No.3所示的反向引物:
5'‑AACCGGTTGCACAGGTAGTC‑3'。
3.一种采用权利要求1所述的InDel分子标记或权利要求2所述的引物对在检测水稻芽期耐冷能力中的应用。
4.一种用于检测水稻芽期耐冷能力的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求2所述的引物对。
5.一种用于检测水稻芽期耐冷能力的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1:提取待检测水稻样本的基因组DNA;
S2:以提取的基因组DNA为模板,采用权利要求2所述的引物对进行PCR扩增;
S3:对PCR扩增产物进行电泳检测,若出现与权利要求1所述的InDel4分子标记相同的电泳条带,则所述待检测水稻样本为具有芽期耐冷能力的水稻;否则,待检测水稻样本为不具有芽期耐冷的水稻。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤S2中的PCR扩增体系为:2×Phanta Max Mix 5μL,正向引物0.5μL,反向引物0.5μL,模版DNA 1μL,双蒸水3μL。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增程序为:95℃预热3min;34个循环:95℃变性30s,58℃退火40s,72℃延伸30s;最后72℃延伸5min。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述电泳程序为:4%琼脂糖凝胶电泳,恒压250v,500A,电泳时间15min。
9.一种利用权利要求1所述的InDel4分子标记或权利要求2所述的引物组在水稻种质资源分析或分子标记辅助育种中的应用。