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专利号: 2022110730306
申请人: 临沂大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
更新日期:2026-04-09
缴费截止日期: 暂无
联系人

摘要:

权利要求书:

1.一种检测链格孢菌引起烟草赤星病的试剂盒,其特征在于,包括:用于识别链格孢菌的ITS种属特异序列的HP1,以及lambda外切酶、探针P1、分子信标MB;

所述链格孢菌的ITS种属特异序列为SEQ ID NO:1;

所述HP1的核苷酸序列为SEQ ID NO:2;

所述P1的核苷酸序列为SEQ ID NO:3;

所述MB的核苷酸序列为SEQ ID NO:4。

2.根据权利要求1所述的一种检测链格孢菌引起烟草赤星病的试剂盒,其特征在于,所述HP1的5'端修饰有磷酸基团。

3.根据权利要求1所述的一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的试剂盒,其特征在于,所述MB的5'‑端修饰有FAM,3'‑端修饰有BHQ‑1。

4.根据权利要求1所述的一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的试剂盒,其特征在于,所述HP1的浓度为1.0μM,lambda外切酶加入量为1U,P1的浓度为0.6μM~1.8μM,MB的浓度为

1μM。

5.一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的方法,其特征在于,提取链格孢菌基因组,将链格孢菌基因组中的ITS种属特异性序列与HP1进行杂交,获得杂交链,用lambda外切酶依

2+

次去除杂交链中HP1的5'‑磷酸化端核苷酸,释放出部分Mg 依赖的脱氧核酶序列,再与P1杂

2+ 2+ 2+

交,组装形成完整的Mg 依赖的脱氧核酶,在Mg 存在的情况下,完整的Mg 依赖的脱氧核酶识别并剪切含核糖核酸的底物分子信标MB,释放荧光基团,出现明显的荧光信号,经荧光分光光度计检测即可。

6.根据权利要求5所述的一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、基因组的提取:

从受链格孢菌侵染的烟草植株中提取链格孢菌的基因组;

S2、材料准备:

取用于识别链格孢菌的ITS种属特异序列的HP1,以及lambda外切酶、探针P1、分子信标MB、反应液,备用;

S3、检测:

S3‑1、初次杂交:

将链格孢菌的基因组与HP1加入反应液中,所述链格孢菌基因组浓度为10pg/L‑100pg/L,链格孢菌的基因组中的ITS种属特异序列与HP1进行杂交反应,反应时间为20min,获得杂交产物;

S3‑2、外切:

向S3‑1的反应体系中加入lambda外切酶,lambda外切酶与杂交产物进行外切反应,反应时间为20min,获得反应产物;

S3‑3、二次杂交:

向S3‑2的反应体系中加入P1,P1与所述反应产物进行杂交反应,反应时间为40miin,获

2+

得完整的Mg 依赖的核酶;

S3‑4、三次杂交:

2+

继续向S3‑3的反应体系中加入MB,MB的rA位点被所述Mg 依赖的脱氧核酶切割,MB中的

2+

荧光‑淬灭基团发生分离,出现荧光信号;所述Mg 依赖的脱氧核酶不断识别剪切MB,使荧光信号增强。

7.根据权利要求6所述的一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的方法,其特征在于,步骤S1中,从受链格孢菌侵染的烟草植株中提取链格孢菌的基因组的方法为:S1‑1、将受链格孢菌侵染的烟草植株放入研磨袋,加入相对于所述烟草植株2倍质量的缓冲液进行碾磨,所述缓冲液的组成成分为:10mM Tris‑Cl、1mM EDTA,缓冲液的pH为8.0;

S1‑2、研磨后的混悬液经沸水浴加热10min,再经冰水冷却后涡旋1min,使链格孢菌基因组将从其细胞壁内释放出来;

S1‑3、将涡旋后的混悬液离心,取上清液1μL,以快速定量检测链格孢菌基因组。

8.根据权利要求6所述的一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的方法,其特征在于,所述S3‑1、S3‑2、S3‑3、S3‑4中,反应条件均为:37℃;

所述S3‑1、S3‑3、S3‑4中,在反应开始前,先将待反应体系置于95℃孵育1min。

9.根据权利要求6所述的一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的方法,其特征在于,步骤S3‑1中,所述反应液为:1×lambda exonuclease反应缓冲液,所述lambda exonuclease反应缓冲液的组成为:67mM Glycine‑KOH、2.5mM MgCl2、0.01%TritonX‑100,反应缓冲液在25℃时的pH为9.4。

10.根据权利要求6所述的一种检测链格孢菌引起的烟草赤星病的方法,其特征在于,

2+

步骤S3‑4中,所述Mg 的终浓度为20mM,所述缓冲溶液的组成成分为:25mM HEPES、100mM NaCl,缓冲溶液的pH 7.0。