1.一种早期鉴别红橙变异植株的分子标记,其特征在于,所述分子标记为甜橙Cs3g14240基因,位于三号染色体第18641380‑18646722之间,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一组用于扩增权利要求1所述分子标记SEQ ID NO:1序列的引物对,其序列如下:P1:如SEQ ID NO:2所示;
P2:如SEQ ID NO:3所示。
3.一种早期鉴别红橙变异植株的方法,其特征在于,包括以下步骤:提取早期红橙苗待检样品总RNA;
以mRNA为模板,逆转录成cDNA;
以权利要求2所述引物对对cDNA进行PCR扩增,获得PCR产物;
对PCR产物进行分析,鉴定早期红橙变异植株类型,筛选出橙型红肉果类型的植株;
培育筛选的红肉果类型植株,进行培育,并对筛选的结果进行验证。
4.权利要求1所述分子标记的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:对红橙橙型红肉果、橙型黄肉果和橘变果三个样品组进行转录组分析;
通过韦恩图分析,找出橙型红肉果、橙型黄肉果和橘变果三个样品组中共有或独有的差异基因;
筛选差异基因,并对差异基因进行表达分析,在橙型红肉果表达量最大的差异基因即为权利要求1所述分子标记。