1.一种改良的Csy4序列,其特征在于,是在Csy4序列起始密码子的5’端增加了Kozak序列,Kozak的碱基序列为:gccgccacc;在Kozak序列的5’端增加了β‑globin 5’ mRNA序列,β‑globin 5’ mRNA的碱基序列如SEQ ID NO.2所示;改良的Csy4序列的碱基序列如SEQ ID NO.1所示。
2.一种Csy4序列的改良方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)根据密码子的偏好性、GC含量、mRNA二级结构及顺势作用元件,对Csy4序列进行优化改良;
(2)在改良的Csy4碱基序列的起始密码子的5’端增加了Kozak序列:gccgccacc,同时,为了增加mRNA的稳定性,在Kozak序列5’端增加了β‑globin 5’mRNA序列,优化后的Csy4称之为GKCsy4,GKCsy4的碱基序列如SEQ ID NO.1所示;
(3)方便载体构建,在GKCsy4序列两端分别添加ClaI和AvaI酶切位点。
3.一种如权利要求1所述的改良的Csy4序列在斑马鱼多基因敲除中的应用,其特征在于,所述改良的Csy4序列为GKCsy4。
4.如权利要求3所述的改良的Csy4序列在斑马鱼多基因敲除中的应用,其特征在于,包括如下步骤:(1)GKCsy4序列的合成;
(2)pCS2‑GKCsy4载体的构建:使用ClaI和AvaI DNA内切酶分别双酶切pCS2质粒和两侧带有ClaI和AvaI酶切位点的GKCsy4序列,反应条件,37℃、2小时,割胶回收后,利用T4 DNA连接酶连接酶切后的pCS2骨架和GKCsy4序列,获得pCS2‑GKCsy4表达载体,即CMV‑GKCsy4‑polyA表达载体;
(3)针对斑马鱼dnd基因靶序列的设计及DgRNA序列合成:针对斑马鱼dnd基因进行敲除位点的设计,分别在第一外显子和第二外显子上各设计一个靶位点,两个靶位点相距
199bp,第一外显子上的靶位点序列为 Ccagcagcaggagcttcagc,称为位点1,第二外显子上的靶位点序列为 Ctctgcaggaatggatgcag,称为位点2,包含位点1和位点2的gRNA称之为DgRNA,其中DgRNA序列如SEQ ID NO.12所示,并将DgRNA序列体外转录;
(4)体外转录获得Cas9 mRNA:利用Cas9质粒,合成Cas9 mRNA;
(5)Cas9 mRNA和DgRNA及pCS2‑GKCsy4质粒载体显微共注射,然后对已经显微共注射后的胚胎进行GFP‑nanos3’UTR mRNA的二次注射,注射后斑马鱼胚胎,养殖48h开始观察PGCs的数量变化。