1.一种猪精子畸形率相关的分子遗传标记，其特征在于，所述分子遗传标记为H3GA0014627标记，所述H3GA0014627标记位于猪4号染色体第123567821bp位置，所述第

123567821bp位置为一个C>T突变位点，猪参考基因组为Sscrofa11.1。

2.根据权利要求书1中所述的猪精子畸形率相关的分子遗传标记，其特征在于，所述H3GA0014627的标记的核苷酸序列为突变位点的上下游100bp序列。

3.根据权利要求书2中所述的猪精子畸形率相关的分子遗传标记，其特征在于，所述H3GA0014627的标记的核苷酸序列为：

5’-CTGAGTACCAGTTAACCCAGGACCGCAGCAGGTCTTTATCCAGCAGTACCCCTCGGTGTCAGCTCGGTGGGGCCTCACCGCGGTGTAATGTGTAGGATACHTAAGCGGTGCGGTTTTCGCAGGAGAGGATCTGCCCAAGGCGGTGGTTTAATTGCCATTCTTTCAGTACGTGTCATGGGCACATTCATCAGGCATTGCTGT-3’，其中H为突变位点。

4.如权利要求1-3任意一项所述的猪精子畸形率相关的分子遗传标记在猪育种上的应用。

5.根据权利要求书4中所述的猪精子畸形率相关的分子遗传标记在猪育种上的应用，其特征在于，所述猪精子畸形率相关的分子遗传标记在猪育种上的应用的方法为通过检测H3GA0014627标记的基因型来辅助种猪的选育，H3GA0014627标记的基因型CC与TT公猪个体间单次采精精子畸形率具有差异性，T等位基因显著降低精子畸形率，选留每次采精精子畸形率低的TT基因型纯合猪，通过持续选育，可有效的降低精子畸形率，加快优质公猪的选育。