1.一种公猪有效精子数相关的分子遗传标记，其特征在于，所述分子遗传标记为SNP分子遗传标记，SNP分子遗传标记位于猪2号染色体147528447bp位置，属于NC_010444基因内含子序列，位置为一个T>C突变的突变位点，猪参考基因组为Sscrofa11.1。

2.根据权利要求1所述的一种公猪有效精子数相关的分子遗传标记，其特征在于，所述SNP分子遗传标记的序列为突变位点的上下游100bp序列。

3.根据权利要求2所述的一种公猪有效精子数相关的分子遗传标记，其特征在于，所述SNP分子遗传标记的序列为以下所示：

5’-ATCAACTATGACTTTCTTTTCAGAAAAAAAGCAGCTGCAATTCTACACCAGGAATGCAGGTAATCACACTTAACAAGTAATATAGTGTCTGCTGCAGCTARTAAATCTCGTATTTTTCAACCTCACACAATGAATACTCCTCATCAATTAAAAGAAAAACAAAAACAACTGCAGTTCCCATTGCGGCTCAGTGGTAACGAA-3’，其中，R为突变位点，当R为C时，猪显著提高有效精子数。

4.权利要求3所述的一种公猪有效精子数相关的分子遗传标记在影响公猪精子有效精子数辅助选择中的应用。

5.根据权利要求4所述的分子遗传标记在影响公猪精子有效精子数辅助选择中的应用，其特征在于，分子遗传标记为SNP分子遗传标记ALGA0123896，ALGA0123896标记基因型CC与TT公猪个体间单次采精有效精子数相差44.53亿，C等位基因显著提高有效精子数，选留每次采精有效精子数含量高的CC基因型纯合猪，通过持续选育，可有效提高有效精子数量，加快优质公猪的选育进度。