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专利号: 2017106023848
申请人: 西南大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
更新日期:2026-06-16
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.一种用于鉴定结球甘蓝开花早晚的InDel分子标记,命名为InDel-FLC2,其核苷酸序列如Seq ID No.1所示。

2.如权利要求1所述的分子标记,其特征在于:晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因缺失所述分子标记,早开花结球甘蓝的BoFLC2基因含有所述分子标记;具体地,晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列缺失所述分子标记,早开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列含有所述分子标记;进一步具体地,晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列第一个内含子区域缺失所述分子标记,早开花结球甘蓝的BoFLC2基因编码区序列第一个内含子区域含有所述分子标记。

3.权利要求1所述分子标记的引物对,上游引物序列如SEQ ID NO.2所示,下游引物序列如SEQ ID NO.3所示。

4.权利要求1所述分子标记的获得方法,包括以下步骤:

步骤(1):锚定早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因的差异区段;

步骤(2):测序获得早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因核苷酸序列,结合步骤(1)锚定的差异区段,比较获得差异的核苷酸序列信息;

步骤(3):根据差异区段核苷酸序列信息,设计引物对,对结球甘蓝进行基因型分析;

步骤(4):结合早开花、晚开花结球甘蓝的开花期表型数据和其基因型,获得分子标记。

5.如权利要求4所述的获得方法,包括以下步骤:

步骤(1):设计结球甘蓝BoFLC2基因上游的启动子区域引物对和BoFLC2基因编码区引物对,选取样本数大于10的早开花、晚开花结球甘蓝,分别进行PCR扩增,比较获得早开花、晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因中具有统计学差异的区段;

步骤(2):测序获得早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因核苷酸序列,结合步骤(1)获得的具有统计学差异的区段,比较获得差异区段核苷酸序列信息;

步骤(3):根据步骤(2)获得的差异区段核苷酸序列信息,设计引物对,对结球甘蓝进行基因型分析;

步骤(4):结合早开花、晚开花结球甘蓝的开花期表型数据和基因型,鉴定获得分子标记,所述分子标记位于BoFLC2基因编码区第一个内含子区域,长度为215bp,晚开花结球甘蓝BoFLC2基因编码区第一个内含子区域缺失所述分子标记,早开花结球甘蓝BoFLC2基因编码区第一个内含子区域含有所述分子标记。

6.如权利要求4或5所述的获得方法,包括以下步骤:

步骤(1):设计结球甘蓝BoFLC2基因上游的启动子区域引物对和BoFLC2基因编码区引物对,选取样本数大于10的早开花、晚开花结球甘蓝,分别进行PCR扩增,比较早开花、晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因中具有统计学差异的区段;如果早开花、晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因中具有统计学差异的区段为编码区段时,可以进一步设计BoFLC2基因编码区序列前段、中段和后段区域引物对,分别对样本数大于10的早开花、晚开花结球甘蓝DNA进行PCR扩增,比较锚定早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因存在统计学差异的区段;

步骤(2):测序获得早开花和晚开花结球甘蓝的BoFLC2基因序列,结合步骤(1)锚定的存在统计学差异的区段,比较获得差异区段的核苷酸序列信息;

步骤(3):根据步骤(2)获得的差异区段核苷酸序列信息,设计引物对,对结球甘蓝进行基因型分析;

步骤(4):结合早开花、晚开花结球甘蓝的开花期表型数据和基因型,鉴定获得分子标记,所述分子标记位于BoFLC2基因编码区第一个内含子区域,长度为215bp,晚开花结球甘蓝BoFLC2基因编码区第一个内含子区域缺失所述分子标记,早开花结球甘蓝BoFLC2基因编码区第一个内含子区域含有所述分子标记。

7.权利要求1或2所述分子标记和/或权利要求3所述分子标记引物对在选育晚开花结球甘蓝育种材料和/或品种中的用途。

8.权利要求1或2所述分子标记和/或权利要求3所述分子标记引物对鉴定结球甘蓝开花早晚的方法,包括以下步骤:步骤a:以待鉴定材料的DNA作为模板,用权利要求3所述的分子标记引物对进行PCR扩增,上游引物序列如SEQ ID NO.2,下游引物序列如SEQ ID NO.3所示;

步骤b:将PCR产物进行凝胶电泳分离成像,扩增产物大小为490-510bp者为早开花结球甘蓝,扩增产物大小为270-290bp者为晚开花结球甘蓝。