1.一种多聚谷氨酰胺致病机理的分析方法，其特征在于，包括以下步骤，S1、选择蛋白质模型：二维整点HP模型；

S2、确定能量函数：

其中，σi表示肽链上第i个氨基酸残基，ri表示第i个氨基酸位置；A为一正整数；m、n为网格节点数；

S3、搜索自由能最小的蛋白质二维构型：采用对等模式的MPI并行算法搜索能量最小的蛋白质所对应的二维结构的步骤为，S31、确定α,β以及Tref的值，每个进程随机产生个体i，其中i＝0,…,N-1，，并计算个体的能量函数Ei，初始化记录器，其中，Tref为初始参考温度，α为分配因子，β为降温因子；

S32、建立通信，确定个体的ri以及个体的温度Ti；

S33、利用构型变动集进行随机变动，构建新的构型，并计算新的能量函数Enew，对t累加；

S34、重复步骤S33，当迭代步数超过阈值，停止计算；否则，Tref＝βTref，β为降温因子，返回步骤S32再次迭代。

2.根据权利要求1所述的分析方法，其特征在于，所述二维整点HP模型具体为，蛋白质链由两种类型的氨基酸的序列构成，分别是亲水氨基酸用P表示和疏水氨基酸用H表示，将每个氨基酸定义为一个节点，P用白球表示，H用黑球表示。

3.根据权利要求1所述的分析方法，其特征在于，所述步骤S2还包括根据蛋白质折叠过程中的HP模型的构型变动集。

4.根据权利要求1所述的分析方法，其特征在于，所述初始化记录器包括MCS步数记录器t＝0，迭代步数记录器k＝0。

5.根据权利要求1所述的分析方法，其特征在于，所述步骤S32具体为，所有进程相互通信，根据每个个体i的能量函数决定个体的ri，其中ri可为1到N的整数值，并根据下式确定每个个体的温度：

其中，α为分配因子，其中0<α<1。

6.根据权利要求1所述的分析方法，其特征在于，所述步骤S32具体为，在每个进程中，对原来的二维构型利用构型变动集进行随机变动，构建新的构型，并计算新的能量函数Enew，同时根据Metropolis准则确定新构型被接受(即替换原来的构型)的概率：

7.根据权利要求1所述的分析方法，其特征在于，所述步骤S34中所述重复步骤次数为

100次；并对迭代步数k赋值，k＝k+1，当迭代步数k超过阈值，所述阈值为20，即kmax＝20，停止计算。

8.根据权利要求7所述的分析方法，其特征在于，所述降温因子β取值为0.9。