本发明涉及室内位置管理技术领域,具体涉及基于WiFi探针的目标定位系统,包括多个移动端、多个WiFi探针和多个探测端,WiFi探针检测移动端并发送连接数据,探测端与WiFi探针一一对应,探测端包括探测模块和处理模块,探测模块获取相对应WiFi探针和竖直向上相邻楼层的连接数据发送至处理模块,处理模块识别连接数据中的方位角信息,处理模块根据方位角信息识别竖直方向上相邻楼层的WiFi探针;处理模块识别该相邻楼层WiFi探针的连接数据中移动端的强度信息,处理模块在强度信息大于预设强度时根据收到的初始楼层信息判断WiFi探针所在的楼层位置,处理模块根据强度信息和楼层位置判断移动端的位置信息。本发明能够提高目标在高层建筑内垂直方向上的位置定位准确性。