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专利号: 2024116384240
申请人: 黄礼峰
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
更新日期:2026-06-16
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.一种病原微生物基因组数据库的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤S1:获取病原微生物基因组序列;对病原微生物基因组序列进行病原特征点位解析,得到病原特征点位数据;

步骤S2:根据病原特征点位数据对病原微生物基因组序列进行生理生化特性分析,得到病原基因组生理生化特性数据;根据病原基因组生理生化特性数据进行基因组演化关系模拟,得到基因组演化关系数据;对基因组演化关系数据进行前置关系联动识别,得到前置关系联动数据,步骤S2包括以下步骤:步骤S21:根据病原特征点位数据对病原微生物基因组序列进行生理生化特性分析,得到病原基因组生理生化特性数据;

步骤S22:对病原基因组生理生化特性数据进行环境权重影响识别,得到生理生化环境权重影响数据;

步骤S23:根据生理生化环境权重影响数据对病原微生物基因组序列进行基因组演化关系模拟,得到基因组演化关系数据,步骤S23包括以下步骤:步骤S231:对生理生化环境权重影响数据进行时空维度作用强度解析,得到时空维度作用强度数据;

步骤S232:根据时空维度作用强度数据对病原微生物基因组序列进行压力化学反应变化分析,得到病原时空压力化学反应变化数据;

步骤S233:基于病原时空压力化学反应变化数据对病原微生物基因组序列进行基因片段变异概率计算,得到基因片段变异概率数据;

步骤S234:对基因片段变异概率数据进行变异趋势定量预测,得到基因片段变异趋势定量数据;

步骤S235:根据基因片段变异概率数据和基因片段变异趋势定量数据对病原微生物基因组序列进行基因组演化关系模拟,得到基因组演化关系数据;

步骤S24:对基因组演化关系数据进行前置关系联动识别,得到前置关系联动数据;

步骤S3:对前置关系联动数据进行关系嵌套结构分析,得到前置联动关系嵌套结构数据;根据前置联动关系嵌套结构数据对前置关系联动数据进行关系编码索引构建,得到联动关系编码索引,步骤S3包括以下步骤:步骤S31:对前置关系联动数据进行关系嵌套结构分析,得到前置联动关系嵌套结构数据;

步骤S32:根据前置联动关系嵌套结构数据对病原基因组生理生化特性数据进行病原微生物群体遗传结构分析,得到病原微生物群体遗传结构数据,步骤S32包括以下步骤:步骤S321:根据前置联动关系嵌套结构数据对病原基因组生理生化特性数据进行生化属性相似性对比,得到基因组生化属性相似数据;

步骤S322:对基因组生化属性相似数据进行基因丰度计算,得到基因相似丰度数据;

步骤S323:根据基因相似丰度数据对基因组生化属性相似数据进行遗传群体性分化分析,得到基因遗传群体性分化数据,步骤S323包括以下步骤:根据基因相似丰度数据对基因组生化属性相似数据进行基因丰度相似性分布矩阵构建,得到基因丰度相似性分布矩阵;

对基因丰度相似性分布矩阵进行Fst值计算,得到基因相似Fst值;

根据基因相似Fst值对基因丰度相似性分布矩阵进行遗传群体性分化分析,得到基因遗传群体性分化数据;

步骤S324:基于基因遗传群体性分化数据和基因相似丰度数据进行病原微生物群体遗传结构分析,得到病原微生物群体遗传结构数据;

步骤S33:根据前置联动关系嵌套结构数据和病原微生物群体遗传结构数据对前置关系联动数据进行关系编码索引构建,得到联动关系编码索引,步骤S33包括以下步骤:步骤S331:根据前置联动关系嵌套结构数据和病原微生物群体遗传结构数据对前置关系联动数据进行关系结构耦合分析,得到前置关系结构耦合数据;

步骤S332:对前置关系结构耦合数据进行加权相关性评估,得到前置关系结构加权相关数据;

步骤S333:对前置关系结构加权相关数据进行编码处理,得到前置关系结构编码数据;

步骤S334:通过B+树算法对前置关系结构编码数据进行关系编码索引构建,得到联动关系编码索引;

步骤S4:对联动关系编码索引进行动态检索条件匹配,得到联动关系动态检索条件;根据联动关系动态检索条件进行缓存架构优化,得到联动关系缓存优化架构;利用联动关系缓存优化架构对病原微生物基因组序列进行基因组数据库构建,得到病原微生物基因组数据库,步骤S4包括以下步骤:步骤S41:对联动关系编码索引进行支持范围查询限定,得到支持范围查询限定数据;

步骤S42:根据支持范围查询限定数据对联动关系编码索引进行动态检索条件匹配,得到联动关系动态检索条件;

步骤S43:根据联动关系动态检索条件和缓存数据库进行缓存架构优化,得到联动关系缓存优化架构;

步骤S44:利用关系型数据库和联动关系缓存优化架构对病原微生物基因组序列进行基因组数据库构建,得到病原微生物基因组数据库。

2.根据权利要求1所述的病原微生物基因组数据库的构建方法,其特征在于,步骤S1包括以下步骤:步骤S11:获取病原微生物基因组序列;

步骤S12:对病原微生物基因组序列进行低质量序列过滤,得到病原微生物基因组过滤序列;

步骤S13:对病原微生物基因组过滤序列进行功能分类标识,得到微生物基因组功能分类序列;

步骤S14:对微生物基因组功能分类序列进行病原特征点位解析,得到病原特征点位数据。

3.根据权利要求1所述的病原微生物基因组数据库的构建方法,其特征在于,步骤S43包括以下步骤:步骤S431:根据支持范围查询限定数据进行缓存访问极值估计,得到范围查询缓存访问极值数据;

步骤S432:根据范围查询缓存访问极值数据对缓存数据库进行缓存替换策略设计,得到访问缓存替换策略;

步骤S433:基于访问缓存替换策略和范围查询缓存访问极值数据进行缓存架构优化,得到联动关系缓存优化架构。