1.一种波纹唇鱼微卫星荧光多重PCR的方法,其特征是包括以下步骤:(1)提取波纹唇鱼DNA:采集波纹唇鱼样品的鳍条组织,提取基因组DNA;
(2)合成SSR多重PCR引物:SSR多重PCR引物包括12对特异性引物和两条荧光标记通用引物M13和PQE‑F,分别为引物对Cun463、Cun378、Cun500、Cun626、Cun672、Cun586、Cun148、Cun752、Cun230、Cun27、Cun485和Cun484,将12对特异性引物分为两组,分别为G1组和G2组,其中G1组包括引物对Cun463、Cun378、Cun500、Cun626、Cun672、Cun586和Cun148,G2组包括引物对Cun752、Cun230、Cun27、Cun485和Cun484;
(3)多重PCR扩增:利用步骤(2)中的两组特异性引物和两条荧光标记通用引物对步骤(1)中的基因组DNA进行PCR扩增,得扩增产物;
(4)遗传多样性评估:对扩增产物进行基因分型,统计每个位点和个体的等位基因,根据杂合度指标比较遗传多样性;
步骤(2)中所述12对特异性引物中每对引物包括一个正向引物和一个反向引物,所述
12对特异性引物的碱基序列依序分别如SEQ ID NO:1 24所示。
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2.根据权利要求1所述的波纹唇鱼微卫星荧光多重PCR的方法,其特征是:步骤(2)中与所述通用引物M13相配合的荧光标记为5‑FAM,与所述通用引物PQE‑F相配合的荧光标记为
5‑HEX。
3.根据权利要求1所述的波纹唇鱼微卫星荧光多重PCR的方法,其特征是:步骤(3)中PCR扩增时,G1组多重PCR扩增反应体系如下所示:G1组PCR体系反应物 含量(µL)Chun463.F 20µM 0.06Chun463.R 20µM 0.24Chun378.F 20µM 0.06Chun378.R 20µM 0.24Chun500.F 10µM 0.06Chun500.R 10µM 0.24Chun626.F 20µM 0.06Chun626.R 20µM 0.24Chun672.F 10µM 0.06Chun672.R 10µM 0.24Chun586.F 10µM 0.06Chun586.R 10µM 0.24Chun148.F 20µM 0.06Chun148.R 20µM 0.24M13 10µM 0.36
PQE‑F 10µM 0.36BSA 2mg/mL 0.45DNA 50ng/µL 2.0Taq HS Takara 12.5ddH2O 7.23
Total 25.0
。
4.根据权利要求1所述的波纹唇鱼微卫星荧光多重PCR的方法,其特征是:步骤(3)中PCR扩增时,G2组多重PCR扩增反应体系如下所示:G2组PCR体系反应物 含量(µL)Cun752.F 10µM 0.06Cun752.R 10µM 0.24Cun230.F 20µM 0.06Cun230.R 20µM 0.24Cun27.F 10µM 0.06Cun27.R 10µM 0.24Cun485.F 10µM 0.06Cun485.R 10µM 0.24Cun484.F 10µM 0.06Cun484.R 10µM 0.24M13 10µM 0.36
PQE‑F 10µM 0.36BSA 2mg/mL 0.45DNA 50ng/µL 2.0Taq HS Takara 12.5ddH2O 7.83
Total 25.0
。
5.权利要求1‑4任一项所述的方法在评估波纹唇鱼遗传多样性方面的应用。