1.一种鉴别抗旱青稞的试剂盒,其特征在于:包括检测待检青稞的抗旱相关基因如下SNP位点的试剂;
所述抗旱相关基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
所述SNP位点为SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的第138位。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂为: KASP方法用试剂或限制性片段长度多态性方法用试剂。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:它还包括扩增SEQ ID NO:1所示的序列的试剂。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:所述扩增SEQ ID NO:1所示的序列的试剂包括SEQ ID NO.2 ~SEQ ID NO.3所示的引物对。
5.一种鉴别抗旱青稞的方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)提取待检青稞样本的基因组总DNA;
(2)检测抗旱相关基因中如下SNP位点,分析即可;
所述抗旱相关基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
所述SNP位点为SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的第138位。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述检测的步骤如下:
1)以步骤(1)提取的DNA为模板,利用扩增试剂进行PCR扩增得到扩增产物;
2)对步骤1)所得PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测;
3)对步骤2)的检测结果中在3Kbp有明亮条带的PCR扩增产物进行测序,得到核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的抗旱相关基因序列;
4)对步骤3)得到的抗旱相关基因上游的如下SNP位点进行分析: SEQ ID NO:1所示核苷酸序列中第138位;
步骤1)所述扩增试剂包括SEQ ID NO:2 3所示的引物对;所述的PCR扩增的退火温度60~℃;步骤3)所述测序为毛细管电泳的Sanger测序。
7.如权利要求5或6所述的方法,其特征在于,所述SNP位点的碱基如下,则待检青稞为非干旱敏感型青稞;
SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的第138位为A。