1.一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法包括以下步骤：(1)搭建集成深度神经网络框架：由ACNet和多尺度CapsNet两种网络集成得到深度神将网络框架；

(2)数据集的选取：磷酸化数据集PhosphoData1训练集、多个独立测试集；

(3)使用信息增益方法优化过的融合特征作为网络输入特征；

(4)使用步骤(1)搭建的集成深度神经网络框架在数据集上预测模型；

(5)模型参数设置；

(6)将待测蛋白质序列输入模型，预测出该蛋白是否有磷酸化位点及其位置。

2.根据权利要求1所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述磷酸化数据集PhosphoData1训练集中筛选的5000个样本；多个独立测试集分别为PhosphoData1的测试集、Phospho.ELM、PhosphoData2的测试集和PhosphoData3。

3.根据权利要求2所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述的训练集和测试集中蛋白质残基长度为27，且任何两种蛋白质残基的相似性都小于

50％。

4.根据权利要求1所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述融合特征包含位置特异性计分矩阵(PSSM)、氨基酸的理化性质、RECM转换矩阵和RECM构成特征。

5.根据权利要求4所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述位置特异性计分矩阵(PSSM)是通过HHblits程序在uniprot_sprot database搜索同源序列，然后构建出多序列比对(MSA)，最后计算得出。

6.根据权利要求4所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述氨基酸理化性质包括疏水性、亲水性、侧链分子量、极性、侧链质量、侧链体积、曲线形状指数、残基可及表面、信息熵以及表面区域溶解能力。

7.根据权利要求4‑6任意一项所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述RECM转换矩阵采用氨基酸成对能量矩阵RECM表示。

8.根据权利要求7任意一项所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述RECM构成特征是通过对RECM转换矩阵先按氨基酸分组，然后再按行求和产生的。

9.根据权利要求1所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述的ACNet包含3×3、3×1和1×3的三个卷积核的非对称卷积块，并将其输出求和，然后将结果输入到之后的网络结构中继续进行训练。

10.根据权利要求1所述一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法，其特征在于，所述多尺度CapsNet使用两个不同大小的卷积核m×m和n×n得到两个PrimaryCaps层，再然后融合两个PrimaryCaps层通过动态路由机制生成的结果，将其输入到DigitCaps中，得到最终的预测结果。