1.与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记组合,其特征在于,所述SNP分子标记组合包括PB.57703.1‑685、PB.93518.1‑182、PB.93518.1‑191、PB.93518.1‑224、PB.93518.1‑270、PB.93518.1‑284、PB.93518.1‑288、PB.103793.1‑1118、PB.103793.1‑1172、PB.103793.1‑
1175、PB.47687.1‑148、PB.47687.1‑215、PB.47687.1‑258、PB.47687.1‑264、PB.47687.1‑
282、PB.47687.1‑297、PB.47687.1‑360、PB.47687.1‑366、PB.47687.1‑367、PB.85097.1‑
125、PB.85097.1‑197、PB.85097.1‑293、PB.85097.1‑356、PB.85097.1‑532、PB.35678.1‑
1129、PB.70158.1‑51、PB.70158.1‑187、PB.70158.1‑306、PB.70158.1‑314、PB.70158.1‑
408、PB.70158.1‑413、PB.70158.1‑419、PB.70158.1‑473、PB.70158.1‑649、PB.70158.1‑
704、PB.70158.1‑707、PB.70158.1‑778、PB.70158.1‑854、PB.70158.1‑930、PB.70158.1‑
935、PB.70158.1‑944、PB.70158.1‑1025、PB.76391.3‑1354、PB.76391.3‑1385、PB.76391.3‑1417、PB.63477.1‑1109、PB.63477.1‑1163和PB.63477.1‑1166;
其中,SNP分子标记PB.57703.1‑685含有如SEQ ID NO.19所示序列第685位的多态性为C/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.93518.1‑182含有如SEQ ID NO.20所示序列第182位的多态性为T/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1‑191含有如SEQ ID NO.20所示序列第191位的多态性为T/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1‑224含有如SEQ ID NO.20所示序列第224位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1‑270含有如SEQ ID NO.20所示序列第270位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1‑284含有如SEQ ID NO.20所示序列第284位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1‑288含有如SEQ ID NO.20所示序列第288位的多态性为C/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.103793.1‑1118含有如SEQ ID NO.21所示序列第1118位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.103793.1‑1172含有如SEQ ID NO.21所示序列第1172位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.103793.1‑1175含有如SEQ ID NO.21所示序列第1175位的多态性为A/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.47687.1‑148含有如SEQ ID NO.22所示序列第148位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1‑215含有如SEQ ID NO.22所示序列第215位的多态性为G/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1‑258含有如SEQ ID NO.22所示序列第258位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1‑264含有如SEQ ID NO.22所示序列第264位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1‑282含有如SEQ ID NO.22所示序列第282位的多态性为T/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1‑297含有如SEQ ID NO.22所示序列第297位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1‑360含有如SEQ ID NO.22所示序列第360位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1‑366含有如SEQ ID NO.22所示序列第366位的多态性为T/C的核苷酸序列,PB.47687.1‑367含有如SEQ ID NO.22所示序列第367位的多态性为G/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.85097.1‑125含有如SEQ ID NO.23所示序列第125位的多态性为C/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1‑197含有如SEQ ID NO.23所示序列第197位的多态性为G/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1‑293含有如SEQ ID NO.23所示序列第293位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1‑356含有如SEQ ID NO.23所示序列第356位的多态性为T/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1‑532含有如SEQ ID NO.23所示序列第532位的多态性为A/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.35678.1‑1129含有如SEQ ID NO.24所示序列第1129位的多态性为G/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.70158.1‑51含有如SEQ ID NO.25所示序列第51位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑187含有如SEQ ID NO.25所示序列第187位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑306含有如SEQ ID NO.25所示序列第306位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑314含有如SEQ ID NO.25所示序列第
314位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑408含有如SEQ ID NO.25所示序列第408位的多态性为T/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑413含有如SEQ ID NO.25所示序列第413位的多态性为T/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑419含有如SEQ ID NO.25所示序列第419位的多态性为A/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑
473含有如SEQ ID NO.25所示序列第473位的多态性为C/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑649含有如SEQ ID NO.25所示序列第649位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑704含有如SEQ ID NO.25所示序列第704位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑707含有如SEQ ID NO.25所示序列第707位的多态性为A/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑778含有如SEQ ID NO.25所示序列第778位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑854含有如SEQ ID NO.25所示序列第854位的多态性为A/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑930含有如SEQ ID NO.25所示序列第930位的多态性为C/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑935含有如SEQ ID NO.25所示序列第935位的多态性为T/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑944含有如SEQ ID NO.25所示序列第944位的多态性为A/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1‑
1025含有如SEQ ID NO.25所示序列第1025位的多态性为C/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.76391.3‑1354含有如SEQ ID NO.26所示序列第1354位的多态性为A/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.76391.3‑1385含有如SEQ ID NO.26所示序列第1385位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.76391.3‑1417含有如SEQ ID NO.26所示序列第
1417位的多态性为T/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.63477.1‑1109含有如SEQ ID NO.27所示序列第1109位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.63477.1‑1163含有如SEQ ID NO.27所示序列第1163位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.63477.1‑1166含有如SEQ ID NO.27所示序列第
1166位的多态性为A/C的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记组合,其特征在于,所述SNP分子标记中多态性位点的基因型及其对应的油茶种仁含油率表型如下所示:
3.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记组合的引物,其特征在于,包括以下引物:
如SEQ ID NO.1‑2所示的PB.57703.1‑685的引物;
如SEQ ID NO.3‑4所示的PB.93518.1‑182、PB.93518.1‑191、PB.93518.1‑224、PB.93518.1‑270、PB.93518.1‑284、PB.93518.1‑288的引物;
如SEQ ID NO.5‑6所示的PB.103793.1‑1118、PB.103793.1‑1172、PB.103793.1‑1175的引物;
如SEQ ID NO.7‑8所示的PB.47687.1‑148、PB.47687.1‑215、PB.47687.1‑258、PB.47687.1‑264、PB.47687.1‑282、PB.47687.1‑297、PB.47687.1‑360、PB.47687.1‑366、PB.47687.1‑367的引物;
如SEQ ID NO.9‑10所示的PB.85097.1‑125、PB.85097.1‑197、PB.85097.1‑293、PB.85097.1‑356、PB.85097.1‑532的引物;
如SEQ ID NO.11‑12所示的PB.35678.1‑1129的引物;
如SEQ ID NO.13‑14所示的PB.70158.1‑51、PB.70158.1‑187、PB.70158.1‑306、PB.70158.1‑314、PB.70158.1‑408、PB.70158.1‑413、PB.70158.1‑419、PB.70158.1‑473、PB.70158.1‑649、PB.70158.1‑704、PB.70158.1‑707、PB.70158.1‑778、PB.70158.1‑854、PB.70158.1‑930、PB.70158.1‑935、PB.70158.1‑944、PB.70158.1‑1025的引物;
如SEQ ID NO.15‑16所示的PB.76391.3‑1354、PB.76391.3‑1385、PB.76391.3‑1417的引物;
和,如SEQ ID NO.17‑18所示的PB.63477.1‑1109、PB.63477.1‑1163、PB.63477.1‑1166的引物。
4.含有权利要求3所述的引物的试剂或试剂盒。
5.权利要求1或2所述的SNP分子标记组合或权利要求3所述的引物或权利要求4所述的试剂或试剂盒的以下任一应用:(1)在鉴定油茶种仁含油率表型中的应用;
(2)在油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用,所述油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种的性状为油茶种仁含油率;
(3)在油茶种仁含油率的早期预测中的应用;
(4)在筛选高含油率油茶中的应用。
6.鉴定油茶种仁含油率表型的方法,其特征在于,包括:
(1)提取待鉴定油茶的总RNA,反转录合成cDNA;
(2)以cDNA为模板,利用权利要求3所述的引物进行PCR扩增;
(3)分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记组合的基因型,根据所述基因型判断待鉴定油茶的含油率表型。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述PCR扩增的反应程序为:94~95℃,3~5min;94~95℃,15~30s,65~69℃,40~60s,38~45个循环;67~70℃,3~
6min。
8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定油茶的含油率表型的方法为:
根据如下所示的SNP分子标记中多态性位点的基因型及油茶种仁含油率表型的对应关系进行判断:
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,若超过39个位点为高含油率基因型,则待鉴定油茶为高含油率表型;若少于等于30个位点为高含油率基因型,则待鉴定油茶为低含油率表型。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,若少于等于28个位点为高含油率基因型,则待鉴定油茶为低含油率表型。