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专利号: 2020101580353
申请人: 电子科技大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
更新日期:2026-06-16
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.一种ceRNA竞争模块识别方法,其特征在于,包括:

分别根据核糖核酸RNA1的表达矩阵和RNA2的表达矩阵获取所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,其中,所述RNA1和所述RNA2为微小核糖核酸miRNA靶基因;

根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,识别得到满足条件的ceRNA竞争模块,其中,所述ceRNA竞争模块包括内部竞争模块和外部竞争模块。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,识别得到满足条件的内部竞争模块,包括:分别获取RNA1-RNA1模块和RNA2-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值;

若所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块的所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值,所述典型相关系数值大于第二阈值,所述敏感典型相关系数值大于第三阈值,则确认所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块分别为所述RNA1-RNA1内部竞争模块和所述RNA2-RNA2内部竞争模块。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,识别得到满足条件的外部竞争模块,包括:分别获取RNA1-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值;

若所述RNA1-RNA2模块的所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值,所述典型相关系数值大于第二阈值,所述敏感典型相关系数值大于第三阈值,则确认所述RNA1-RNA2模块为所述RNA1-RNA2外部竞争模块。

4.如权利要求1-3任一所述的方法,其特征在于,在识别得到满足条件的ceRNA竞争模块之后,还包括:获取所述ceRNA竞争模块与目标疾病的评估结果。

5.一种ceRNA竞争模块识别装置,其特征在于,包括:

获取模块,用于分别根据核糖核酸RNA1的表达矩阵和RNA2的表达矩阵获取所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,其中,所述RNA1和所述RNA2为miRNA靶基因;

识别模块,用于根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,识别得到满足条件的ceRNA竞争模块,其中,所述ceRNA竞争模块包括内部竞争模块和外部竞争模块。

6.如权利要求5所述的装置,其特征在于,所述识别模块,具体用于分别获取RNA1-RNA1模块和RNA2-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值;

若所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值,所述典型相关系数值大于第二阈值,所述敏感典型相关系数值大于第三阈值,则确认所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块为所述RNA1-RNA1内部竞争模块和所述RNA2-RNA2内部竞争模块。

7.如权利要求5所述的装置,其特征在于,所述识别模块,具体用于分别获取RNA1-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值;

若所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值,所述典型相关系数值大于第二阈值,所述敏感典型相关系数值大于第三阈值,则确认所述RNA1-RNA2模块为所述RNA1-RNA2外部竞争模块。

8.如权利要求5-7任一所述的装置,其特征在于,所述ceRNA竞争模块识别装置还包括评估模块,用于获取所述ceRNA竞争模块与目标疾病的评估结果。

9.一种电子设备,其特征在于,包括处理器、存储介质和总线,所述存储介质存储有所述处理器可执行的机器可读指令,当所述电子设备运行时,所述处理器与所述存储介质之间通过所述总线通信,所述处理器执行所述机器可读指令,以执行权利要求1-4任一项所述方法的步骤。

10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器运行时执行权利要求1-4任一项所述方法的步骤。