1.一种基因定位方法,其特征在于,包括:
获取待处理基因数据,所述待处理基因数据包括待检全基因组测序数据和待检转录组数据;
对所述待检全基因组测序数据进行低频单核苷酸多态性筛选,获取初始基因列表;
对所述初始基因列表和所述待检转录组数据进行基因共表达网络分析,获取联动基因列表;
将所述初始基因列表和所述联动基因列表,投影到基因调控网络中,获取潜在异常模体;
获取标准基因模体,对所述标准基因模体和所述潜在异常模体进行拓扑相似性计算,获取目标异常基因。
2.如权利要求1所述的基因定位方法,其特征在于,所述获取待处理基因数据,所述待处理基因数据包括待检全基因组测序数据和待检转录组数据,包括:获取原始基因数据;
采用第二代测序技术对所述原始基因数据进行处理,获取待检全基因组测序数据;
采用转录组测序技术对所述原始基因数据进行处理,获取待检转录组数据。
3.如权利要求1所述的基因定位方法,其特征在于,所述对所述待检全基因组测序数据进行低频单核苷酸多态性筛选,获取初始基因列表,包括:采用单核苷酸多态性数据库、人类基因组单体型图和外显子组整合数据库,对所述待检全基因组测序数据进行低频单核苷酸多态性筛选,获取潜在异常基因;
对所述潜在异常基因进行检索,确定所述潜在异常基因对应的基因位置;
根据所述潜在异常基因对应的基因位置和已知异常基因列表,获取初始基因列表。
4.如权利要求1所述的基因定位方法,其特征在于,所述将所述初始基因列表和所述联动基因列表,投影到基因调控网络中,获取潜在异常模体,包括:将所述初始基因列表和所述联动基因列表,投影到基因调控网络中,获取拓扑信息;
基于所述拓扑信息,获取潜在异常模体。
5.如权利要求1所述的基因定位方法,其特征在于,所述对所述标准基因模体和所述潜在异常模体进行拓扑相似性计算,获取目标异常基因,包括:对所述标准基因模体和所述潜在异常模体进行拓扑相似性计算,获取拓扑相似值;
对所述拓扑相似值进行排序,获取相似值排序列表;
基于所述相似值排序列表,获取目标异常基因。
6.如权利要求5所述的基因定位方法,其特征在于,所述对所述标准基因模体和所述潜在异常模体进行拓扑相似性计算,获取拓扑相似值,包括:获取所述标准基因模体对应的第一特征向量和潜在异常模体对应的第二特征向量;
采用向量相似性计算公式对所述第一特征向量和第二特征向量进行计算,获取拓扑相似值。
7.如权利要求1所述的基因定位方法,其特征在于,所述对所述初始基因列表和所述待检转录组数据进行基因共表达网络分析,获取联动基因列表,包括:计算初始基因列表和所述待检转录组数据的基因之间的相关系数;
提取相关系数大于系数阈值的基因作为联动基因,并生成联动基因列表。
8.一种基因定位装置,其特征在于,包括:
待处理基因数据获取模块,用于获取待处理基因数据,所述待处理基因数据包括待检全基因组测序数据和待检转录组数据;
低频单核苷酸多态性筛选模块,用于对所述待检全基因组测序数据进行低频单核苷酸多态性筛选,获取初始基因列表;
基因共表达网络分析模块,用于对所述初始基因列表和所述待检转录组数据进行基因共表达网络分析,获取联动基因列表;
潜在异常模体获取模块,用于将所述初始基因列表和所述联动基因列表,投影到基因调控网络中,获取潜在异常模体;
目标异常基因获取模块,用于获取标准基因模体,对所述标准基因模体和所述潜在异常模体进行拓扑相似性计算,获取目标异常基因。
9.一种计算机设备,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至
7任一项所述基因定位方法的步骤。
10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7任一项所述基因定位方法的步骤。