1.一种来源于福建金线莲的查尔酮合酶基因，其特征在于，所述查尔酮合酶基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示；所述查尔酮合酶基因的CDS序列通过转录组测序拼接得到。

2.如权利要求1所述的查尔酮合酶基因，其特征在于，其氨基酸序列如SEQ ID NO：2所示。

3.如权利要求1所述的查尔酮合酶基因，其特征在于，其编码区序列如SEQ ID NO：3所示。

4.含有权利要求1所述的查尔酮合酶基因的重组质粒。

5.如权利要求4所述的重组质粒，其特征在于，所述质粒为pC2300‑35S‑CHS‑eGFP、pET28a(+)‑CHS或pZZ00026‑Ubi‑CHS‑T‑nos。

6.一种如权利要求1所述的查尔酮合酶基因在调控水稻黄酮含量中的应用。