1.桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)染色体玻片标本的制备:将桑树嫩叶于浓度为0.002M的8-羟基喹啉水溶液中、
25℃避光预处理3小时,用固定液固定后用水冲洗,然后将桑叶于1/15M的KCl溶液中、
25℃低渗30~60分钟,低渗后用水冲洗,再将冲洗后的桑叶于含3-5%(W/V)纤维素酶和
3-5%(W/V)果胶酶的混合酶液中、25℃酶解2-5小时,用水冲洗后在水中处理10~120分钟;然后将材料磨成匀浆,加入固定液,静置5min弃沉淀,收集上层细胞悬液,将收集的细胞悬液再静置30min,收集下层细胞悬液,然后将细胞悬液滴在载玻片上,微微加热烤干,再将载玻片置于35-40℃的烘箱中烘片30min-120min,-20℃保存备用;
(2)5S rDNA和25S rDNA探针标记:分别以含有SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的重组质粒为模板,分别以SEQ ID NO.1与SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3与SEQ ID NO.4为引物,采用PCR法合成地高辛或生物素标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的探针,分别得5S rDNA探针和25S rDNA探针;
(3)染色体荧光原位杂交:将步骤(1)保存的染色体玻片标本在37℃条件下烘片2h,然后用RNase浓度为100μg/mL的2×SSC溶液在37℃温育1h,再用蛋白酶K浓度为1μg/mL的2×SSC溶液在37℃孵育15min,接着在37℃用2×SSC洗涤5min,在18-25℃用2×SSC洗涤2次,每次5min;然后在72℃条件下用含70%(V/V)去离子甲酰胺的2×SSC溶液变性
10min,完毕在18-25℃下依次用-20℃预冷的体积分数为70%、90%和100%的无水乙醇各处理5min,晾干;然后向染色体玻片标本上加封阻液,并在37℃封阻15min,再用含5S rDNA探针或/和25S rDNA探针的变性杂交液加在封阻的染色体玻片标本上,盖片后在80℃共变性10min;然后在37℃孵育过夜,接着在37℃下用含10%(V/V)去离子甲酰胺的2×SSC溶液洗10s,在37℃下用2×SSC溶液洗涤2次,每次3min,再在18-25℃下用含0.2%(V/V)吐温-20的4×SSC溶液洗3min;然后在37℃下用1×封闭液封闭20min,再在染色体玻片标本上滴加荧光标记的抗地高辛或生物素的抗体,在37℃避光孵育1h,然后在37℃下,用含
0.2%(V/V)吐温-20的4×SSC溶液洗3min,再在18-25℃下用含0.2%(V/V)吐温-20的
4×SSC溶液洗3min,接着在18-25℃下用浓度为1μg/mL的DAPI避光复染5min,用2×SSC溶液清洗2min后在染色体制片上滴加抗荧光淬灭剂,盖片,封片,镜检。
2.根据权利要求1所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:所述固定为用固定液于4℃条件下固定至少2小时,所述固定液为甲醇与冰乙酸体积比为3:1的溶液。
3.根据权利要求1所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:所述含有SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的重组质粒由如下方法制备:以川桑基因组DNA为模板,分别以SEQ ID NO.1与SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3与SEQ ID NO.4为引物对进行PCR扩增,分别获得如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列,然后分别与pMD19-T载体连接,分别得含有SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的重组质粒。
4.根据权利要求1所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:合成所述探针的反应体系为:50pg含有SEQ ID NO.5或SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的重组质粒,1μM SEQ ID NO.1与1μM SEQ ID NO.2或1μM SEQ ID NO.3与1μM SEQ ID NO.4所示的引物,200μM dATP,200μM dCTP,200μM dGTP,130μM dTTP,70μM DIG-dUTP或Biotin-dUTP,0.75μL聚合酶,5μL10×PCR Buffer,加ddH2O至总体积为50μL。
5.根据权利要求1所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:合成所述探针的反应条件为:95℃预变性2min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸40s,30次循环,最后72℃延伸7min,4℃保存。
6.根据权利要求1所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:所述杂交液各组分的终浓度如下:2×SSC,125ng/μL的鲑鱼精DNA,0.25%(W/V)SDS,10%(W/V)DS,
50%(V/V)去离子甲酰胺,6ng/μL探针。
7.根据权利要求1所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:所述变性杂交液的变性方法如下:将杂交液于95℃变性6min,再置冰上孵育至少10min。
8.根据权利要求1所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:所述封阻液为2×SSC,125ng/μL的鲑鱼精DNA,0.25%(W/V)SDS,10%(W/V)DS,50%(V/V)去离子甲酰胺。
9.根据权利要求1-8任一项所述桑树中期染色体的荧光原位杂交方法,其特征在于:
所述荧光标记的抗地高辛抗体是浓度为2ng/μL的荧光素标记的抗地高辛抗体,所述荧光标记的抗生物素抗体是浓度为10ng/μL的Cy3标记的抗生物素抗体。